某日，小新（矢岛晶子 配音）在河堤上捡到了一瓶微妙的液体，把它带回家放在了冰箱里哪知道美伢（楢桥美纪 配音）和广志（藤原启治 配音）在有意之中将其喝下，隔天居然变异成为了植物  之后，一个微妙的环保组织SKBE掳走了小新一家人，而为首的，居然是双叶里的里长四膳守（山寺宏一 配音）。原来，四膳首是一位保守的环保主义着，妄图经过一种微妙的药物将破坏环境的人类全部都变成植物，而小新捡到的微妙液

某日，野原新之助（矢岛晶子 配音）正在公园里和风间（真柴摩利 配音）、妮妮（林玉绪 配音）等冤家们游玩，不测遇见了一位名为金有久美子（钉宫理惠 配音）的微妙女子，久美子通知小新，自己来自于悠远的未来世界，而彼时曾经长大成人的新之助，正是自己的未婚夫  跟随着久美子，小新一行人分开了未来，在那里，金友电机的社长，亦是久美子的父亲金有增藏手握大权，并且绑架了不时和自己作对的新之助得知小新的到

故事发作在春日部的中华街上的《哎呀城》，「正男」约请「小新」与「春日部防卫队」，学习传说中的功夫－软Q软Q拳并和功夫少女「小兰」一同努力练功。这时分，奥秘面食”黑熊猫拉面”大盛行。那是只需吃过一次就会上瘾，且让人变得凶暴的恐惧拉面！面对这突如袭来的拉面危机！为了挽救哎呀城，春日部防卫队自告奋勇，他们可以恢复街上的战争吗？

小新往年5岁了，不要以为他是那种懵懂无知的小孩，他其实人小鬼大，喜欢美丽的姐姐，收养了一条棉花糖一样的漂泊狗——小白，还经常讲些无厘头的黄色笑话小新的妈妈美伢是一个全职主妇，大意而又有点神经质的她经常被小新玩弄得怒不可遏，爸爸野原亦经常被这两母子搞得晕头转向 《蜡笔小新》的作者以一个5岁小童的目光，40岁的成年人的心态去观察这个大千世界，看到了许多光怪陆离的现象，小新一家的幽默故事亦由此发作。

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