北高加索地域，恐惧分子头领巴兹加耶夫命令他的军队去筹集资金，以置办可以替代的对空攻击系统；莫斯科，拉维尔将军结合叶戈尔少校设立了一个特别举动组，目的是追踪巴兹加耶夫的躲藏地点并根除他。就在拉维尔一行前往北高加索的同时，巴兹加耶夫在格鲁吉亚追踪到了一批老式导弹并命令手下伊沙运送出境。在追踪到钱款流向后，举动组员拷问巴兹加耶夫的保镖，得知了他的位置，代号为“清算方案”的举动行将启动，谋划数次恐惧袭击的

反恐特战队队长钟原在执行义务中，击毙猛犸组织二号人物引来复仇。在挽救妻子赵欣的举动中钟原被注射病毒倍受折磨。DK生物公司董事长江寒约请初爱情人、生化专业高材生的赵欣及其父亲参与公司有益菌”研讨。反恐指挥中心依据T国央求选派“专家”潜入公司。痛失爱子的赵欣自动请缨“参与现役”、深化虎穴。接二连三的恐惧事情，使“新纪元方案”逐渐浮出水面。被病痛折磨的钟原率领乔大鹏、麦萌萌等特战队员绝地反击，在爱妻赵欣

秦晓阳和唐石是从小一同长大的“铁哥们”，一次偶然事情使两人走进分属两个对决阵营秦晓阳不测取得“密钥”并应征退伍离开以计算机信息化网络人才为主要强军目的的“天狼”特战队，在网络高手朱丽彤的配合下潜入国际恐惧组织暗网平台“天堂之门”，并与不时深爱的大数据专家姜玫、特战队员段宇哲以及老一代反恐精英一同，与恐惧分子集团斗智斗勇，挫败了一次次恐惧事情，最后在唐石的协助下一举摧毁暗网平台，打击了国际恐惧组织。

杨灿（朱雨辰 饰）的父亲逝世之前独一的愿望就是可以看见儿子参与特战队，杨灿以自己的举动完成了父亲的遗愿在特战队中，杨灿遇见了名为那敏（王力可 饰）的女教官，两人唇枪舌战，对峙不下之后，杨灿结识了毛晓波（李浩轩 饰）、塔西（张晶 饰）和老黑等战友，在艰辛的训练和危机重重的实战中，一群情投意合的同伴们结下了深沉的友谊。 那敏的前男友历剑锋（王斑 饰）回到了连队中，他的回归搅乱了那敏和好友石雨（孙艺铭

黑日组织在国际股市移走了500亿美元资金，希图用这笔资金中止恐惧活动经费并且栽赃中国神鹰反恐特战队将计就计，启动R4举动在杨灿、那敏、柳诗文等潜伏人员和厉剑锋率领的特战队员的完美配合下，粉碎了冤家。

H国黑日组织为了暗杀要歼灭恐惧权益的总统候选人阿巴斯部长，趁他在中国出访，派杀手刺身行刺神鹰反恐特战队接到命令迅速出动，布下天罗地网抓捕刺身打击越境恐惧分子，最终促进两国反恐协议签署