日暮戈薇是就读于国中三年级的15岁普通小女生，某日，她偶然经过家中神社的枯井分开了500年前的战国时代时狼烟四起，妖怪横行，人世大地安居乐业戈薇在御神木那里邂逅了被封印的半妖犬夜叉。50年前，意欲变成真正妖怪的犬夜叉，为了失掉四魂之玉结识拥有弱小灵力的巫女桔梗。经过一段时间相处，两人之间发作了感情。犬夜叉因此希望变成人类，而桔梗也方案在污染完四魂之玉后过回普通人的生活。但是，对桔梗心存邪念的盗贼鬼