2006年，为配合NDS版（钻石、珍珠版）的上市，TV动画同步推出全新系列《神奇宝贝钻石&珍珠》（Pokémon Diamond & Pearl，简称DP）。对战开拓区篇终了后，小遥为了独自应战城都地域的华美大赛和小智告别，小胜回到了橙华道馆，小刚也回家去了。小智则遭到了小茂的鼓舞，独自带着皮卡丘和偷渡的长尾怪手前往神奥地域应战联盟。 新退场的女主角小光，其蓝本取自电玩NDS版。