故事发作在1956年的法国，一名牧师惨遭谋杀，某种罪恶正在散播，艾琳修女（泰莎·法米加 Taissa Farmiga 饰）将再次与鬼修女瓦拉克（邦妮·阿伦斯 Bonnie Aarons 饰）展开正面对决。

一个年轻修女在罗马尼亚与世隔绝的修道院自杀，梵蒂冈派去一名神父和一名快完毕见习期的修女展开调查，而神父有令人毛骨悚然的过去他们一同揭开了教会罪恶的秘密，不只冒着生命风险，还拿信仰和灵魂当赌注，面临着一股狠毒的力气，恶魔修女再次成为弱小的要挟。