团侦探学园Q班的学生们终于迎来了他们第一次的实战任务。所谓Q班，就是指由那些有资格成为团守彦接班人的学生组成的“Qualified Class(合格班)”的简称。虽然拥有敏锐的观察力、出类拔萃的洞察力以及超越常人的灵敏感觉，不仅靠推理、证据，而且可以通过感受人们真实的情感和内心来解决事件，但却有点胆小的Q。拥有过目不忘瞬间记忆能力，且是Q班唯一的女生的小惠。有着天才般的头脑，体育万能却讨厌与人交往，总是酷酷的如同谜一般存在的流。不仅是电脑神童，而且是大财阀的公子，小不点富豪侦探数马。武道十段的超级运动天才，班级中最年长的金太。Q班就是由这5个个性迥异的成员组成的。接到作为老师且是团侦探左右手的
还没从上次事件令人震惊的结局中缓过气来，Q班的5人又接到了来自团守彦的新任务。这次的任务是调查中学生失踪案。收到一封署名“神的邮件”的两个中学生，在看了这封洗脑邮件后就不见了。中学生失踪事件自然引起了舆论的轩然大波，然而就在几天后，失踪了的两个中学生又毫发无损的出现在秋叶原站前的马路上。不但对失踪时的事情一点也不记得，更不可思议的是就连自己失踪前的记忆也没有了，简直就像是换了一个人似的。Q和小惠于是参加了两人失踪前的辅导班进行秘密调查。这时，辅导班里发生了一起离奇的密室杀人案件。调查被害人心理问题的流，不知道被谁袭击的金太，“神的邮件”的内容到底是什么。之前的失踪事件与这次的杀人事件之间的关系
“彻底追查被称为社会垃圾清理者的连续杀人事件的凶手”Q班的5人接到了团守彦的新任务。所谓社会垃圾清理者就是那些专门袭击没有反抗能力的流浪者的年轻人，或者因手法残忍出名的帮会组织等，将被认为是社会垃圾的人残忍杀死并弃尸于垃圾场的这类连续杀人犯的通称。由于这次的任务过于危险，任务室里弥漫着紧张的气氛。尽管如此，Q班的5人还是开始各自的搜查。但是只有数马无论如何也没办法集中精力展开调查。既无法继续新游戏的开发，也无法像Q班其他4个人那样投身于新任务的调查。“单纯真好！”和自己不同，单纯的Q能够马上集中精力投身调查工作中的，而自己做事总是有始无终，就在这时数马遇到了瑶子。而这个就在离秘密基地很近的花店
