日本战国时期，分属不同大名的忍者集团也在暗处停止着角力。在一个月朗星稀的夜晚，伊贺忍者耶麻汰（三元雅芸饰）,阵内（柏原收史饰）,老鼠等人执行探听义务时不测与对手相，时期天空中突然飘过一个庞大的火球，令众人颇感不测。耶麻汰等回到村中后，在首领的指示下又去森林中探查火球的真相。途中他们邂逅同属一派的凛林（肘井美佳饰）及其同伴，众人结伴同行。结果在密林中，伊贺忍者们遭到不明生物的袭击。对方矫捷迅速，杀伤力庞大，忍者们接二连三遇害。耶麻汰,阵内,凛林等人虽幸运逃出，殊不知来自外星的异型正大肆繁衍。

一时间，伊贺村落惨遭荼毒，耶麻汰等也面临史无前例的应战…