经过上一集的腥风血雨之后，伯恩（马特·达蒙 饰）和女冤家玛丽（弗兰卡·泼坦特 饰）隐居在印度偏远的海边小镇，想遗忘以前的生活。一天，奥秘组织的杀手离开小镇，打破了伯恩二人世界的安静，女友玛丽在押亡途中被枪杀。 

为了查出真相，伯恩重新末尾战役，他发现以前任务的中情局末尾重新寻觅他，自己被卷入了一场刺杀活动中，被人诬害破坏了情局的一次情报买卖，杀害特工。伯恩别无选择，他只能找到冒充自己的人，才干洗刷洁白，为女友报仇。