《来自新世界》改编自贵志祐介所著的科幻类小说作品1000年后的日本，孩子们不时地消逝，只存在想象中的恐惧植物与人类展开殊死战争反乌托邦式的未来超级社会“新世界”，是口吐真言凭藉“咒力”就能移植物体的人类，与有著同等于普通人智力的生物“妖鼠”共存的世界。乍看之下一切战争，但“新世界”的孩子们的举动被彻底地控制和管束著，不适宜的记忆被消去，被以为有效果的孩子，似乎不良产品般被分开处置。失掉被称为“咒力

小智和皮卡丘等一行同伴在旅途中前行某日，宝可梦波尔凯尼恩突如其来并自愿与小智锁在了一同波尔凯尼恩与被人类损伤过的宝可梦们共同生活，因此十分厌善人类，但这条神奇的锁链却让他们无法分开，巧妙的故事就此末尾。小智与皮卡丘又将一同末尾新的冒险…… 另一方面，在超级机关城市阿佐特王国，大臣贾维斯失掉了终年追求的终极发明——500 年前降生于阿佐特王国的自然宝可梦玛机雅娜。听说在玛机雅娜体内，有被称为 “魂心

故事末尾为第一季故事的七年之后 高达模型对战的规则被改造，亦令其对战更受欢迎 虽然伊织诚和岭司失掉第7回敢达模型对战世界大赛的冠军，也令学校圣凤学园沾光不少。不过，其“高达模型对战部”就只剩下部长—国中部3年级先生·星野文奈一人。 在新竞赛规则底下，假定要参与竞赛必需以3人1组的参与战役。而圣凤学园高达模型对战部郤由于人数缺乏的状况下难以出场。 在偶然的之间，出现了一名转校生，就是跟随徒弟修行多年