北川市郊外的湖内突然出现了恐龙。于是奥特警备队将恐龙冷冻，请环境生态学的户根崎教授中止调查。在夜间恐龙突然消逝。同时户根崎教授面前出现了一对微妙男女，自称是他们让恐龙复生的。他们发明了理想的未来城市「生态都市」。对地球环境好转感到焦虑的户根崎教授为了完成理想而协力，不过这却是梅特龙星人的可怕圈套。

由大帝王GUBIRA所率領的暗黑銀河最大立功組織-不思議界FUMA，對銀河展開片面的侵攻；而地球也不例外。就在此時，巴特星的宇宙刑事養成所正在培育的刑事們奮起抵抗，而其中一人就是負責保衛地球的宇宙刑事夏依達。為了要使夏依達失掉更有力的幫助，總部派遣了另一名女的宇宙刑事－安妮來幫忙夏依達辦案；也由於她的功夫了得，使夏依達可以更担忧的與FUMA一族作