《永诀了霍夫曼先生》的故事设定在二战时期的巴黎，此时巴黎已被纳粹德国占领，霍夫曼先生由于自己的犹太人身份，不得不让家人先走并将自己的珠宝店拜托给自己的下属梅西埃。但是人算不如天算，就在梅西埃与妻子布朗什入主珠宝店没多久，霍夫曼先生再次出如今珠宝店里。由此，三集团的命运纠缠在了一同。

一架从迪拜飞往巴黎的班机，在阿尔卑斯山不幸坠毁。一位年轻又才气横溢的法国航空事故调查人员马修（皮耶尼内饰演），被指派为这起空难的首席调查员。这是驾驶失误？还是技术缺陷？或是恐惧攻击？当这起调查结案时，马修末尾怀疑证据发作效果。当他再度倾听黑匣子的内容时，竟发现一些严重干扰的细节。黑盒子的磁带能否遭到修正？而他对真相的痴迷与追求，能否又会由于违犯下级命令，让他的生命遭到要挟？