ペンギン村にチビッコ怪獣・ドドンガドンが現れた！警察隊が出動したり、見物する村人が大勢集まったりでペンギン村は大騒ぎ!!警察隊はドドンガドンに攻撃を試みるも、ことごとく失敗に終わり、逆にボロボロにやられてしまうさらに、周りの苦労はいざ知らず、アラレとガッちゃんがドドンガドンと怪獣ごっこを始める始末！そんな中、みどり先生に良いところを見せようと、センベエがドドンガドンと戦う決心を固めるのだが…!?&

故事发作在战国时代，普通人家出身的男孩猪名寺乱太郎祖辈曾是忍者，在父亲的劝说下，他分开家乡摄津，进入事前一流的忍者学园学习在学校，他看法了与之同龄的新兵卫和雾丸新兵卫是一个出身富商家庭的小瘦子，为人恍恍惚惚，对吃尤为感兴味；雾丸则是身世贫穷的孤儿，为人精明，贪财吝啬。这三特性情悬殊却的小家伙成为好冤家，他们最大的共同点就是经常由于考试不及格受四奖励。当然，以校长大川平次涡正为首的教员们也都是性情乖