一颗流星划过东京夜空，随它一同到来的还有希腊神话传说中的黄金苹果严酷的孤儿院女教员绘梨衣与孩子们过着安静的生活，但是她遭到黄金苹果的呼唤，化身为纠纷女神艾莉丝为了完成消灭世界的目的，她绑架了女神雅典娜，并用金苹果将其捆住。随同纠纷女神一同复生的还有矢座魔矢、竖琴座奥菲斯、南十字星古拉特、神盾座阿恩、奥利安座渣加等五位亡灵圣斗士。正享用战争生活的星矢、紫龙、瞬和冰河收到艾莉丝送来的应战书，他们重新穿

神话时代，宙斯之子亚伯妄想统治大地，他自称“太阳神”，张扬跋扈妄自尊大，最终遭到宙斯和阿波罗的抹杀 数千年后，亚伯复生，假上天之名欲淹没人类文明，重建众神世界他约请雅典娜和其共同统领世界，并用神力复生战死的黄金圣斗士。假意协作的雅典娜试图暗杀亚伯，反被其所害。 星矢、紫龙、冰河等人来至太阳神殿，遭遇日晷战士和黄金圣斗士的伏击，少年战士伤痕累累，精疲力竭，但只需雅典娜还有一点活转的希望，他们便决不坚