太阳系遭到奇居子破坏之后过了千年。庞大收获船希德尼亚，为了维持人类的繁衍而飞行於太空中。在希德尼亚最底层长大的少年谷风长道，成为卫人训练生的他，被允许驾驶着虽是旧型，但历史悠久的名机继卫。长道赌上性命的战争，如今行将揭开序幕！

曾几何时，微妙生物奇居子入侵太阳系，致使人类流离失所，只能乘坐行星般大小的巨型飞船希德尼娅漂泊在茫茫宇宙中如是过了漫长的一千年，而今希德尼娅的居民们已有一百年不曾遭遇奇居子，不过他们从未抓紧警觉，培育了一代又一代操纵人形兵器“卫人”的驾驶员某天，寓居在地下的青年谷风长道（逢坂良太 配音）迫于饥饿爬到空中，偷米后被人抓住，后在舰长（大原沙耶香 配音）的授意下成为卫人驾驶员第628期的训练生，在这里他