应该是从悠远的宇宙彼方K隆星来侵略地球的KERORO小队，在剧场版中却将地球从可怕的危机中援救出来……这一次，KERORO军曹的面前出现了最新！最恶！最强的冤家！！ 　　故事讲述冬树与KERORO小队一同去印加帝国的马丘比丘足迹欣赏，喜欢微妙事物的冬树当然是大为快乐，可是KERORO的脑袋外面装满了要侵略地球的事情。他们在那里由于迷路而发现了遗址，后因由于突发状况而不得不从那里逃出。但在那时，冬

故事发作在美丽的小村庄村川村，时值暑期，夏纪、小周以及小清等五名小先生，在校舍里中止暑期合宿活动为了找回失踪的宠物小兔，五人进入深山探寻，不测发现了深山里的微妙怪圈，而且还发现了一只受伤的小狗被五人救下的小狗醒后居然启齿说话，他自称是来自犬星的宇宙人，名字叫波奇，他来地球为了一种早已绝种的植物。 为了报答五人的救命之恩，波奇决议完成他们探求宇宙的愿望。于是，一个外形像小狗的外星人，以及五名小先生，

21世纪初，日本生物科技高度兴隆，其所研制并独家垄断的生物机器人极大推进了时代的提高，但同时其潜在的危害性也不时遭到世界各国的指摘。不满于其他国度对该技术限制的呼声，日本于2067年双方面参与结合国，用高科技手段屏蔽一切外来信号，再次进入锁国外形。 尔后整整10年间，关于日本的现状外界一无所知。美国政府急于了解日本以后的状况，虽派出特种部队SWORD秘密潜入这个曾经封锁了十个年头的微妙国度。当特种

曾经，小林三平（喜多村英梨 配音）和一位少女有着一个浪漫的商定，一晃眼十年过去，虽然两人此刻早已天各一方，但小林从未遗忘过这段美妙的回想，并且时辰希望可以再度取得这位少女的音信 某个平平无奇的早晨，当小林睁开眼睛时，却发现一个红衣绿发的机器人出如今自己的身边，机器人名叫可美克（斋藤千和 配音），它此番前来寻觅小林，居然是为了和他结婚就这样，小林在莫明其妙之中末尾了和可美克的同居生活，与此同时，陪伴

故事发作在圣夜学园之中，日奈森亚梦（伊藤加奈惠 配音）是就读于五年级的女生，外表看来，她纸上谈兵特立独行，可实际上，那不过是亚梦害臊的表现罢了，在内心里，她亦希望可以和同窗们顾影自怜，同室操戈。一次偶然之中，亚梦失掉了心灵之蛋，从蛋中孵出的守护甜心，即是她理想中的自己。