从501机关独立,在军外部失掉自在的草雉素子在此时,罗吉库玛被不用身份者入侵,为了调查事情,在移送罗吉库玛的途中,草雉素子遭到武装集团的袭击。在素子面前出现的是拥有<不眠之眼>的前陆军空挺特科队员巴特,对网络情报解析十分拿手的原陆军情报部队员石川,具有特殊任务和电子战技艺的原前陆军空挺特科队员波玛,以及受雇素子停止卧底的陆军警察搜寻员帕兹和海军陆战队员的王牌狙击手斋藤末尾发起还击&he

与恋人腻在一同休假中的草薙素子突然收到了巴特关于炸弹恐惧袭击的紧急报告离开现场后发现恐惧分子的主犯人胸前刻有符号。同一时间,山之手的大坝突然发作爆炸事情，现场的警察殉职。留下的线索仅有被称为“人鱼之脚（MERMAID"SLEG）”的义体技师的名片以及义体的脚部。而殉职的警察的后代陀古萨末尾对事情停止...