新战国时代，忍者们展开着与妖怪们猛烈的战役以战役末了，猿飞佐助为首的5人的忍者们，在自无敌将军们三神将被给予的「封印的门」中关锁妖怪总司令和妖怪们的动力的，事上成功了丧失动力并在人类社会融洽了的妖怪カッパは，诈骗猿飞佐助的子孙佐助和雾隐的子孙才藏，使之开了东京湾有了的封印的门。注视了祖先世世代代封印的门的血缘的少女鹤姫决议与去除了封印的佐助与才藏，三好入道清海的子孙清海，并且从美国来的见雷也的子孙