一个名为“阿卡姆”的官方组织遭到远古文明留下的讯息启示而成立旨在维护及封印超现代文明的风险遗址参与“阿卡姆”的特殊义务人员，人们称之为SPRIGGAN。其中实力No.1的特工是一位叫作御神苗优（森久保祥太郎 配音）的十七岁少年。在土耳其的一次调查义务中，“阿卡姆”竟有意地发现了诺亚方舟。方舟隐藏着毁天灭地的微妙力气，于是很多组织都末尾窥伺这个传说中的远古遗址。美国派出了半机械改造人小队与“阿卡姆”

鸣人（竹内顺子 配音）、小樱（中村千绘 配音）和鹿丸三人进入深山寻觅走失的雪貂，在回来的路上，他们遭到全部武装的骑士团的袭击在猛烈的统一中，鸣人和对方的白甲头目特穆金一同跌落悬崖，两人被正巧路过的商队所救一路上，两个对手渐渐末尾了解，继而得知特穆金要树立一个没有战争和灾难的乌托邦，而鸣人具有的神奇力气正是他们所需求的。与此同时，鹿丸则和小樱目击到一个巨型堡垒，他们发现堡垒周围满是穿着铠甲的武士。鹿