百赞星人的妻子女百赞星人为了给丈夫报仇，派黑色奥特曼夏德奥特曼分开了地球。哉阿斯奥特曼在南极被夏德打败了。受着打败的影响，朝日胜人（关口正晴 饰）失掉决计，从MYDO辞职了。

迷信警备队队员光超一郎从宇宙空间站EGG3前往地球的途中与不明宇宙人遭遇，自称为"奥特曼"的宇宙人通知他地球上的各种怪兽与超自然现象危机迫在眉睫，但奥特曼无法以宇宙人的身姿在地球上暂时生活，所以便借用光超一郎的身体与之合为一体，并可以用"闪光之星"来随时变身，使人类得以应付行将到来的各种危机…作为奥特曼系列的动画版，比起特摄片有固有的优势在这里，主角可以做以

初代奥特曼的剧场版以TV版2、3、8、16、25再编集而成